Структурная биоинформатика · Molecular modeling

Анна Никандрова

+7 906 507-78-06 ann.nikandrowa@yandex.ru Telegram: @ssttoou

Специалист по структурной биоинформатике и молекулярному моделированию в фармацевтическом R&D. Работаю с дизайном малых молекул, комплексами белок–лиганд и белок–белок, молекулярной динамикой и расчётными пайплайнами для ранней разработки лекарств.

Опыт

Медицинский химик

ХимРар · отдел ранней разработки лекарственных средств
  • Разработала серии малых молекул для внутриклеточных мишеней и провела in silico валидацию с использованием докинга, молекулярной динамики, Boltz-2 и FEP. Соединения доведены до in vitro тестирования.
  • Создала расчётный пайплайн генерации и фильтрации белок-белковых комплексов и химерных соединений RIPTAC с сериями линкеров.
  • Разработала модель классификации белковых дегрейдеров и модуляторов на основе 3D-фармакофорных представлений для определения механизма действия на этапе ранней разработки.

Лаборант-исследователь

ИБХ РАН · лаборатория оксилипинов
  • Показала, что комбинированное взаимодействие N-DHA-DA с DOX и TMZ на клеточных линиях LN229 и U87 усиливает цитотоксический эффект в 2–2,5 раза.
  • Подобрала маркеры для оценки клеточной дифференцировки: nestin, GFAP и EAAT2.

Биоинформатический проект

In silico анализ свойств и потенциальных мишеней BPC-157

  • Поиск и приоритизация потенциальных мишеней с помощью анализа мотивов, гомологии подпоследовательностей и сетевого анализа.
  • Верификация гипотез связывания и транспорта через мембрану с помощью MM-GBSA, in silico мутагенеза и MD в водном и мембранном окружении.